Отказ в применении вычетов не приводит к автоматическому образованию недоимки на ту же сумму и не может быть квалифицировано в качестве не уплаченного в бюджет налога. 

  Общество с ограниченной ответственностью обжаловало в суд решение налоговиков об уплате штрафа и недоимки по НДС, вынесенное по тому основанию, что налогоплательщик завысил налоговые вычеты по налогу на эту же сумму.
Со ссылкой на главу 21 Налогового кодекса РФ суд указал, что отказ в применении вычетов не приводит к автоматическому образованию недоимки на ту же сумму и не может быть квалифицировано в качестве не уплаченного в бюджет налога.
Налоговый орган не выяснил, по каким счетам-фактурам Общество получило НДС от покупателей товаров и на какую сумму. В связи с чем нельзя утверждать, что сумма не уплаченного Обществом налога равна сумме налогового вычета, необоснованного им примененного.
Суд также отметил, что данный вывод соответствует правовой позиции Высшего Арбитражного Суда РФ (Постановление Президиума Высшего Арбитражного Суда РФ от 16.01.2007 N 10312/06) и сложившейся судебной практике.